分析：回顧所學知識：原子是化學變化中的最小粒子；在任何原子中，質子數等于電子數；元素的化學性質主要由原子的最外層電子數決定；化合物由兩種或兩種以上元素的原子（指不同元素的原子種類）組成的純凈物．
解答：解：A、原子是化學變化中的最小粒子，在化學變化中，不能再分，故A正確；
B、元素的化學性質主要由原子的最外層電子數決定，說法正確，故B正確；
C、在任何原子中，質子數等于電子數，說法正確，故C正確；
D、不同種類的原子，不能相互結合成分子，說法錯誤，“不同種類的原子，能相互結合成分子”，故D錯誤．
故選D．
點評：了解分子、原子、離子、元素與物質之間的關系；了解物質的組成和物質的構成；掌握核外電子在化學變化中的作用和得失電子的規律特點．
