分析：A、根據分子的性質判斷．
B、根據物質的結構情況判斷．
C、根據化合物分子的結構判斷．
D、根據化學變化的實質判斷．
解答：解：A、分子和原子都是不斷運動的，所以錯誤．
B、直接構成物質的粒子有三種：分子、原子、離子，所以正確．
C、化合物的分子是由不同種原子構成的，如二氧化碳分子是由碳、氧兩種原子構成的，所以錯誤．
D、在化學變化過程中，分子破裂成原子，原子再重新組合成新的分子，反應過程中分子種類一定變，原子的種類和數目不變，所以錯誤．
故選B．
點評：物質的結構是化學考查熱點之一，明確分子、原子、離子的概念，原子內部各種粒子間的質量、電荷、數目關系，是解題的基本要求．
